Das winzige Fischerdorf San Fruttuoso und die Abtei sind nur zu Fuß oder mit dem Schiff erreichbar.
Die Kirche ist auf das 10. Jh. zurückzuführen, während das Kloster im 13. Jh. von der Familie Doria gebaut wurde, dessen Mitglieder sich hier zwischen 1275 und 1305 begraben ließen.
1954 wurde in der Bucht vor dem Kloster eine Bronzestatue des „Cristo degli Abissi“, des Schutzpatrons der Unterwasserfischer, versenkt.
Ende August findet in San Fruttuoso ein stimmungsvolles Fackelfest statt.